292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 181 aa  357  7e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  63.84 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2192  NUDIX hydrolase  63.28 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.349846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  59.89 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 184 aa  124  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  40.46 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 180 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  39.88 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1523  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000782  ADP-ribose pyrophosphatase  39.89 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3753  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.641661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 190 aa  94.4  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  37.57 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3065  hypothetical protein  38.95 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  38.42 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 192 aa  90.9  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  33.72 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6125  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 184 aa  85.1  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  32.07 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  35.39 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  28.4 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1489  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  31.18 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  29.59 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29440  NUDIX family protein  39.89 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 186 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.54 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  35.36 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  32.94 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  30.59 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  32.75 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 187 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4016  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.298866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  31.28 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>