More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 322 aa  614  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  42.37 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  45.39 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  46.31 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  43.37 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  41.22 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  46.2 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  42.22 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  42.81 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  42.42 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  41.7 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  42.16 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  40.2 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  35.81 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  41.91 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.42 
 
 		 342 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  39.67 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  35.99 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.39 
 
 		 312 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  32.58 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  37.95 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  32.79 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.22 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  42.91 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.46 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  35.35 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.38 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  39.09 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  31.35 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  30.59 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  34.15 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  34.11 
 
 		 478 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  28.48 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.03 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.93 
 
 		 303 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  37.02 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  29.58 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  34.82 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.9 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  34.62 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.45 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  32.04 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  32.04 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  35.03 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  34.07 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  33.55 
 
 		 363 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  32.48 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.77 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.36 
 
 		 315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.36 
 
 		 315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  32.32 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.34 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  33.8 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.55 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.35 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.35 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  34.8 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  32.79 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  36.96 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  30.75 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.32 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  30.36 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  34.91 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  32.6 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  32.32 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  31.11 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.12 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.64 
 
 		 404 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  30.36 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  30.36 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  33.75 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  30.36 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  30.03 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  30.36 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  35.24 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  30.36 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  30.36 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.97 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.93 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  34.55 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  32.73 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  36.44 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  29.75 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  31.11 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  34.18 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.39 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  36 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.08 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  32.79 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.63 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  31.51 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  29.57 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.82 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.86 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  26.09 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  33.55 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  23.67 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  35.78 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  36.93 
 
 		 422 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  36.41 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>