177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  100 
 
 
473 aa  945    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.43 
 
 
479 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.84 
 
 
584 aa  352  8e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.89 
 
 
593 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.55 
 
 
515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.27 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.19 
 
 
500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.57 
 
 
530 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.16 
 
 
533 aa  309  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  38.89 
 
 
558 aa  300  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.81 
 
 
528 aa  292  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.42 
 
 
816 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  38.76 
 
 
525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.68 
 
 
820 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.77 
 
 
605 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.25 
 
 
609 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.22 
 
 
481 aa  195  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.87 
 
 
505 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.74 
 
 
422 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.22 
 
 
795 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 
526 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.49 
 
 
785 aa  187  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.41 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.13 
 
 
634 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.53 
 
 
542 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.99 
 
 
553 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.13 
 
 
766 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.54 
 
 
534 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.31 
 
 
613 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.5 
 
 
905 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
529 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.1 
 
 
534 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.71 
 
 
779 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.74 
 
 
762 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 
655 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  29.02 
 
 
795 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.8 
 
 
618 aa  173  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.77 
 
 
765 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.06 
 
 
469 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.07 
 
 
760 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.27 
 
 
493 aa  172  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.72 
 
 
546 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.69 
 
 
504 aa  170  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.25 
 
 
447 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  27.7 
 
 
777 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.07 
 
 
790 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 
772 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.38 
 
 
549 aa  169  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.97 
 
 
618 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.31 
 
 
636 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  31.46 
 
 
639 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  32.53 
 
 
543 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.1 
 
 
821 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  26.72 
 
 
639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  26.62 
 
 
639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.21 
 
 
533 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  27.33 
 
 
602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.03 
 
 
779 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.25 
 
 
613 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.1 
 
 
775 aa  163  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.85 
 
 
636 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.98 
 
 
665 aa  162  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.88 
 
 
614 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.1 
 
 
781 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.54 
 
 
866 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  28.99 
 
 
637 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.18 
 
 
812 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.65 
 
 
834 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.24 
 
 
774 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.87 
 
 
549 aa  154  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.41 
 
 
812 aa  153  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  29.95 
 
 
736 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.77 
 
 
639 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.33 
 
 
627 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.82 
 
 
545 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.91 
 
 
547 aa  150  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  28.91 
 
 
776 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.44 
 
 
525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.68 
 
 
518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
794 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.65 
 
 
628 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.75 
 
 
884 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.95 
 
 
688 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0725  chitinase  41.04 
 
 
856 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540847  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.13 
 
 
673 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3173  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  41.04 
 
 
833 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0143  putative beta-N-acetylhexosaminidase  41.04 
 
 
833 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1445  putative beta-N-acetylhexosaminidase  41.04 
 
 
833 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0540  glycosy hydrolase family protein  41.04 
 
 
833 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2873  putative beta-N-acetylhexosaminidase  41.04 
 
 
833 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  24.41 
 
 
883 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  26.79 
 
 
896 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0451  beta-N-acetylhexosaminidase, putative  40.57 
 
 
836 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.14 
 
 
683 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.71 
 
 
797 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.36 
 
 
853 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  26.02 
 
 
881 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0556  glycosy hydrolase family protein  40.57 
 
 
833 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.18 
 
 
857 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.4 
 
 
688 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>