226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3044 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  86.54 
 
 		 468 aa  811    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  91.3 
 
 		 414 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  71.61 
 
 		 466 aa  676    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  86.32 
 
 		 468 aa  808    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  69.26 
 
 		 481 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  95.51 
 
 		 468 aa  920    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  100 
 
 		 468 aa  952    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  71.37 
 
 		 481 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  95.73 
 
 		 468 aa  922    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  72.25 
 
 		 467 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  86.54 
 
 		 468 aa  807    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  72.9 
 
 		 477 aa  692    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  73.08 
 
 		 468 aa  660    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  85.29 
 
 		 469 aa  825    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  85.9 
 
 		 468 aa  808    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  55.77 
 
 		 472 aa  495  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  46.88 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  50.46 
 
 		 473 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  48.48 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  45.73 
 
 		 471 aa  342  5.999999999999999e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  46.15 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  39.35 
 
 		 468 aa  312  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  42.06 
 
 		 457 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  38.03 
 
 		 525 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  36.84 
 
 		 472 aa  260  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  37.67 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  34.48 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  37.84 
 
 		 495 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.75 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  35.37 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.47 
 
 		 580 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.02 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  25.43 
 
 		 552 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.54 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.32 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  26.64 
 
 		 544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  25.94 
 
 		 526 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.32 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.01 
 
 		 487 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.86 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  25.05 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  26.19 
 
 		 698 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.17 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  25.95 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.41 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.03 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  28.06 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.16 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  23.7 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.4 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  30.21 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  41.46 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  22.27 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  28.87 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  27.39 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  37.86 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  40.91 
 
 		 678 aa  63.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27.36 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  27.87 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  25.81 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  34.83 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.27 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  26.25 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  26.91 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  35.71 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.71 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  40 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.87 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  45.12 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  25.95 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  32.68 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  22.84 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.52 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  25.89 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  23.31 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  39.51 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  40 
 
 		 743 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  32.68 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  30.47 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  39.13 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  42.53 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  27.73 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  25 
 
 		 466 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.73 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  30.46 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  33.86 
 
 		 514 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.67 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  30.46 
 
 		 417 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  39.13 
 
 		 529 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.42 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.58 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.42 
 
 		 466 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  29.95 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.42 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  36.84 
 
 		 550 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  36.84 
 
 		 547 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  31.36 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  28.95 
 
 		 529 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>