More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2642 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2575  secretion protein HlyD family protein  98.22 
 
 		 337 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2642  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 337 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2750  secretion protein HlyD family protein  93.77 
 
 		 337 aa  557  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  86.69 
 
 		 308 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  82.57 
 
 		 383 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  81.64 
 
 		 372 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  81.58 
 
 		 384 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  79.48 
 
 		 332 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  82.47 
 
 		 378 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  60 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  51.34 
 
 		 315 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  39.56 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  38.06 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  38.82 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  39.68 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  38.72 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  38.7 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  38.83 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  39.81 
 
 		 317 aa  196  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  38.02 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1354  secretion protein HlyD family protein  40.13 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  31.4 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.1 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.13 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  32.48 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.58 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.16 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  31.08 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  30.74 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.47 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.3 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  30.03 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  30.03 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  30.03 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  30.03 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  30.03 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  29.77 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  30.53 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.09 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  29.69 
 
 		 331 aa  95.9  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 331 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  32.58 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.24 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  28.52 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  29.69 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  29.69 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  29.69 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  29.69 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  29.69 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  29.69 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  29.69 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  30.64 
 
 		 347 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  31.44 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  27.95 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  31.32 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  27.95 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  26.52 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  30.55 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  23.21 
 
 		 327 aa  89.7  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  29 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  30.69 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  31.79 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.93 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.28 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.83 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  28.38 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  33.11 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  29.21 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  32.04 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.22 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  31.56 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  25.82 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.88 
 
 		 500 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  29.55 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  31.23 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  30.95 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  31.62 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.52 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  21.86 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.53 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  27.81 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 450 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  29.35 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  29 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  29.66 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  26.98 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  31 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  27.38 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.99 
 
 		 504 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.9 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>