299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2684 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1571  gluconate transporter  94.69 
 
 		 452 aa  798    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2778  gluconate transporter  86.95 
 
 		 452 aa  752    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.111665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1771  GntP family permease  96.24 
 
 		 452 aa  824    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2772  Gluconate transporter  94.69 
 
 		 452 aa  800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000382691 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3133  gluconate transporter  87.39 
 
 		 452 aa  755    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0333  permease  78.46 
 
 		 450 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000883  D-glycerate transporter (predicted)  81.02 
 
 		 450 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1471  gluconate transporter  94.69 
 
 		 452 aa  816    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2518  gluconate transporter  99.34 
 
 		 452 aa  871    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.76105  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2586  gluconate transporter  99.34 
 
 		 452 aa  871    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2641  gluconate transporter  86.06 
 
 		 452 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2684  gluconate transporter  100 
 
 		 452 aa  875    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2713  gluconate transporter  88.44 
 
 		 452 aa  765    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1576  gluconate transporter  94.69 
 
 		 452 aa  798    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1605  gluconate transporter  94.69 
 
 		 452 aa  798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2533  gluconate transporter  90.27 
 
 		 452 aa  760    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4328  transporter  70.95 
 
 		 452 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1438  gluconate transporter  72.46 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50770  transporter  70.98 
 
 		 452 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115941 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1025  gluconate transporter  66.3 
 
 		 452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1371  gluconate transporter  67.85 
 
 		 452 aa  580  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0464  Gluconate transporter  60.45 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26270  H+/gluconate symporter family protein  56.66 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  0.0576275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1596  Gluconate transporter  57.62 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.713961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0895  gluconate transporter  51.11 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000913428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1895  gluconate transporter  55.11 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.513788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0535  gluconate transporter  49.34 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.15777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1137  Gluconate transporter  48.97 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1252  gluconate transporter  48.19 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00700727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0207  GntP family permease  45.85 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000342719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  46.03 
 
 		 455 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0611  GntT protein  45.51 
 
 		 462 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0146  Gluconate transporter  44.27 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000250826  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2187  gluconate transporter  44.6 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2739  Gluconate transporter  41.02 
 
 		 444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319275  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0790  Gluconate transporter  39.05 
 
 		 452 aa  275  9e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.65446e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3044  Gluconate transporter  39.01 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0728  gluconate transporter  36.62 
 
 		 461 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000179796  normal  0.654044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3175  gluconate transporter  37.38 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1996  gluconate transporter  36.84 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2455  Gluconate transporter  35.68 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.490712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3118  hypothetical protein  36.61 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632537  normal  0.0276886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3034  GntP  36.61 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3222  hypothetical protein  36.61 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3063  GntP  36.61 
 
 		 498 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3102  gluconate transporter GntP  36.61 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3450  permease DsdX  33.33 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2515  permease DsdX  33.33 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.873662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4081  permease DsdX  33.63 
 
 		 445 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02275  predicted transporter  33.19 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1292  gluconate transporter  33.19 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4026  permease DsdX  33.41 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02236  hypothetical protein  33.19 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4010  permease DsdX  33.41 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4189  permease DsdX  33.41 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1304  permease DsdX  33.19 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.478606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2502  permease DsdX  33.19 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.667372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4131  permease DsdX  33.41 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0918369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1717  permease DsdX  32.6 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.761378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00514  permease  34.47 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001958  low-affinity gluconate/H+ symporter GntU  34.6 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3004  gluconate transporter  34.02 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5329  gluconate transporter  33.62 
 
 		 477 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5418  gluconate transporter  33.62 
 
 		 477 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1234  gluconate transporter  36.69 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5708  gluconate transporter  33.62 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0556  gluconate transporter  33.81 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0378  gluconate permease  33.57 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00016138  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2554  gluconate transporter  34.38 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00434171  hitchhiker  0.00292422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4040  gluconate transporter  32.27 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5482  gluconate transporter  34.65 
 
 		 464 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2931  gluconate transporter  34.8 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0503  gluconate transporter  33.4 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2057  gluconate transporter, permease protein  30.56 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3642  gluconate transporter  31.78 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04754  H+/gluconate symporter  33.41 
 
 		 485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0212  gluconate permease  33.02 
 
 		 487 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2450  permease DsdX  32.27 
 
 		 445 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34630  gluconate permease  34 
 
 		 450 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681344  normal  0.14403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5912  gluconate transporter  32.97 
 
 		 474 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0993393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  30.75 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2938  gluconate permease  33.92 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  30.75 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  30.75 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1488  inner membrane permease YgbN  31.65 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4774  gluconate transporter  31.53 
 
 		 453 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0172668  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3111  gluconate transporter  31.96 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  30.53 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3417  gluconate transporter  32.52 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4018  gluconate transporter  32.44 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.566968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2345  gluconate transporter  32.52 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2523  gluconate transporter  32.52 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.365618  normal  0.0854776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24190  gluconate transporter  32.49 
 
 		 460 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.456069  normal  0.0307448 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2580  gluconate transporter  29.32 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2528  gluconate transporter  29.32 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4271  gluconate transporter  32.13 
 
 		 459 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0017  GntP family permease  34.68 
 
 		 490 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26850  gluconate transporter  32.24 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07730  gluconate transporter  32.87 
 
 		 461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.619912  normal  0.0357152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0463  gluconate transporter  31.37 
 
 		 485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>