More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2194 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  603  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  60 
 
 		 292 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  60 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  56.58 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  58.21 
 
 		 298 aa  292  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  58.4 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  57.84 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  57.67 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.75 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  44.24 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.28 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 329 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.12 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.48 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  28.99 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  30.41 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  28.12 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.91 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.16 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.3 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  31.1 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  26.04 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.68 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.63 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  30.05 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  29.36 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  27.03 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  28.77 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  31.67 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  27.55 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  27.55 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.7 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  28.36 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  25.15 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  27.46 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  27.37 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1509  hypothetical protein  64.18 
 
 		 82 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.585476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  26.26 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  28.46 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  26.26 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  25.43 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  35.23 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  27.99 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  27.99 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.94 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.64 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.21 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  27.53 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.4 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.89 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.08 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  26.09 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.21 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  30.05 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  24.44 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  26.86 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.37 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  27.53 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  24.66 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.08 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  25.16 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.21 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.21 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  24.04 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  25.72 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  30.65 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.93 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2060  hypothetical protein  27.14 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.810367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  27.18 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  31.03 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  26.8 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  25.89 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.93 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25.08 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  29.51 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.78 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.13 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.36 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  29.36 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  28.81 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  23.81 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  31.58 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  25.4 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  26.43 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  28.3 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>