More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3792 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  96.64 
 
 
268 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  97.39 
 
 
268 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  97.76 
 
 
268 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  83.58 
 
 
268 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  84.33 
 
 
268 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  83.96 
 
 
268 aa  447  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  83.96 
 
 
268 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  82.46 
 
 
268 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  68.66 
 
 
268 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  68.28 
 
 
268 aa  374  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  65.3 
 
 
268 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 
299 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  61.15 
 
 
278 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  66.04 
 
 
269 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  62.69 
 
 
268 aa  333  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  48.83 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  43.77 
 
 
356 aa  212  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
270 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 
270 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
268 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  40.53 
 
 
266 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.19 
 
 
270 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
275 aa  178  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
273 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
280 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 
270 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  42.15 
 
 
273 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
270 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
271 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.56 
 
 
263 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  38.72 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  41.6 
 
 
265 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
267 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
269 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
260 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.58 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.65 
 
 
263 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
262 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2168  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.93 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
264 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.08 
 
 
663 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.14 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 
265 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
263 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.93 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.64 
 
 
252 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
262 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.78 
 
 
265 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.9 
 
 
260 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.77 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.59 
 
 
662 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.61 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.16 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
261 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.63 
 
 
662 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
267 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
264 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.95 
 
 
967 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.71 
 
 
659 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  29.62 
 
 
263 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 
258 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
260 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
258 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.62 
 
 
661 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.17 
 
 
651 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
260 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  30.41 
 
 
280 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  31.31 
 
 
257 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 
260 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
259 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  34.88 
 
 
261 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.4 
 
 
273 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  33.95 
 
 
261 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 
260 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
264 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.49 
 
 
260 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.7 
 
 
260 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
280 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.04 
 
 
255 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  30.41 
 
 
270 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>