148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  100 
 
 		 606 aa  1236    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  41.96 
 
 		 592 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  42.19 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  43.08 
 
 		 592 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  40 
 
 		 610 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  34.28 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  33.88 
 
 		 605 aa  350  5e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.53 
 
 		 608 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  35.8 
 
 		 598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  34.39 
 
 		 558 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  34.85 
 
 		 616 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  32.62 
 
 		 821 aa  335  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  33.17 
 
 		 612 aa  334  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  35.06 
 
 		 611 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  34.56 
 
 		 570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  34.6 
 
 		 622 aa  312  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  32.63 
 
 		 612 aa  302  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  31.51 
 
 		 581 aa  300  4e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  32.12 
 
 		 615 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  32.85 
 
 		 647 aa  296  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  31.26 
 
 		 644 aa  296  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  31.69 
 
 		 638 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  29.61 
 
 		 618 aa  294  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  31.89 
 
 		 642 aa  294  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  32.37 
 
 		 657 aa  290  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  29.82 
 
 		 627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  30.83 
 
 		 647 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  31.77 
 
 		 635 aa  280  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  30.7 
 
 		 650 aa  279  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  30.73 
 
 		 652 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  30.16 
 
 		 635 aa  276  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  38.06 
 
 		 529 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  30.46 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  31.19 
 
 		 627 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  31.12 
 
 		 640 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  30.16 
 
 		 673 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  30.02 
 
 		 673 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  30.17 
 
 		 673 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  31.43 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  31.2 
 
 		 630 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  28.27 
 
 		 640 aa  254  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  30.15 
 
 		 612 aa  253  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  28.08 
 
 		 694 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.76 
 
 		 683 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  31.85 
 
 		 535 aa  244  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  28.96 
 
 		 679 aa  239  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  29.54 
 
 		 690 aa  239  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29.82 
 
 		 549 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  31.01 
 
 		 615 aa  237  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  31.99 
 
 		 427 aa  225  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  32.07 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  33.33 
 
 		 512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  29.57 
 
 		 521 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  31.64 
 
 		 424 aa  203  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  28.03 
 
 		 538 aa  203  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  33.18 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  31.92 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.97 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  32.37 
 
 		 410 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  31.97 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  28.78 
 
 		 555 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.83 
 
 		 685 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  26.42 
 
 		 534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  27.79 
 
 		 499 aa  120  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.31 
 
 		 554 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  24.71 
 
 		 514 aa  98.6  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  24.25 
 
 		 639 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  25 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  24.19 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.29 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  21.28 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.31 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  38.03 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.88 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.72 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 		 574 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0692  hypothetical protein  41.94 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.21 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0633  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit F  34.88 
 
 		 369 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0441983  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.95 
 
 		 346 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 		 561 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  36.25 
 
 		 205 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  26.6 
 
 		 577 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 		 547 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  38.37 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.36 
 
 		 407 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2595  ferredoxin  31.82 
 
 		 106 aa  51.2  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000974548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1969  ferredoxin  33.04 
 
 		 123 aa  50.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2653  ferredoxin  31.58 
 
 		 124 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 		 575 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  35.63 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1912  ferredoxin  34.83 
 
 		 106 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  36.59 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.59 
 
 		 407 aa  48.9  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  30.12 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0340  ferredoxin  32.14 
 
 		 117 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000140808  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.92 
 
 		 575 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4087  ferredoxin  36.56 
 
 		 117 aa  47.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>