More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23570 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23570  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  100 
 
 
356 aa  721    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.127654  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10880  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  54.65 
 
 
357 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2466  peptidase M50  53.76 
 
 
364 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.6 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  28.11 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.88 
 
 
355 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  28.72 
 
 
354 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  28.26 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  27.22 
 
 
337 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  27.44 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0712  peptidase M50  34.15 
 
 
456 aa  92  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41926  hitchhiker  0.0000525349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  25.54 
 
 
375 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.08 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.09 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.8 
 
 
343 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1230  peptidase M50  30.65 
 
 
252 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.704176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.52 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.68 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.89 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  29.65 
 
 
454 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  25.34 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  28 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  26.42 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  29.21 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1573  peptidase M50  30.22 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  57.81 
 
 
430 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.61 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  48.24 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0005  peptidase M50  29.89 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  58.46 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  36.51 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  49.33 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  25.07 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  34.88 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  50 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  55.38 
 
 
438 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  44.87 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  50 
 
 
469 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  42.05 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.53 
 
 
558 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  42.05 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  48.68 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  28.16 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23530  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  29.07 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.062078 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  30.28 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  30.05 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  38.82 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  26.7 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.46 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  42.31 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.07 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2528  peptidase M50  34.43 
 
 
434 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  40.91 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.29 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  32.03 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.17 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  32.77 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  28.76 
 
 
453 aa  65.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  47.14 
 
 
357 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.41 
 
 
441 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.63 
 
 
444 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.57 
 
 
495 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  55.22 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  42.05 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  48.1 
 
 
368 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  34.04 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  48.65 
 
 
438 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  25.34 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1400  peptidase M50  31.09 
 
 
443 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  33.61 
 
 
501 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  40.54 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1012  peptidase M50  44.59 
 
 
438 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.25 
 
 
456 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  33.61 
 
 
501 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2281  hypothetical protein  21.99 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  45.21 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1523  peptidase M50  38.89 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  24.03 
 
 
451 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  45.57 
 
 
368 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  40 
 
 
561 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
561 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
561 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.37 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  32.73 
 
 
453 aa  63.5  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.88 
 
 
453 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0991  peptidase M50  24.89 
 
 
268 aa  63.5  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  26.5 
 
 
431 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1303  peptidase M50  38.75 
 
 
416 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  46.15 
 
 
383 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  44.83 
 
 
376 aa  63.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  28.7 
 
 
377 aa  62.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  48.05 
 
 
369 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  38.67 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  26.89 
 
 
421 aa  62.8  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.41 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.3 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  46.91 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  32.33 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  47.06 
 
 
453 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>