More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2925 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2925  aminotransferase class-III  100 
 
 		 474 aa  975    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0539  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2649  aminotransferase class-III  40.28 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  36.43 
 
 		 437 aa  283  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0139  aminotransferase class-III  37.3 
 
 		 452 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000384602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  37.89 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1738  aminotransferase class-III  36.34 
 
 		 465 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243066  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0564  Acetylornithine transaminase  36.43 
 
 		 461 aa  259  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.129985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2019  aminotransferase class-III  36.55 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  35.43 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  34.95 
 
 		 428 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1796  Acetylornithine transaminase  34.26 
 
 		 439 aa  252  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.778199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  37.53 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  36.7 
 
 		 430 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  34.2 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  34.2 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  35.27 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  36.91 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  34.41 
 
 		 479 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  34.79 
 
 		 461 aa  246  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  34.41 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  34.41 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  34.41 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  34.41 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  34.41 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  34.41 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  34.16 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0034  hypothetical protein  34.19 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1055  hypothetical protein  33.18 
 
 		 463 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  33.02 
 
 		 454 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3926  aminotransferase class-III  35.04 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  35.7 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3219  aminotransferase class-III  35.51 
 
 		 442 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.338952 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0687  4-aminobutyrate aminotransferase  32.48 
 
 		 459 aa  239  5.999999999999999e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00660505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0146  4-aminobutyrate aminotransferase  36.14 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0259  4-aminobutyrate aminotransferase  35.58 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0213  2,4-diaminobutyrate 4-transaminase  35.95 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1344  aminotransferase class-III  35.23 
 
 		 445 aa  238  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.252611  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0989  4-aminobutyrate aminotransferase  35.18 
 
 		 458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.48801  normal  0.0598376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  31.93 
 
 		 441 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  34.4 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0532  aminotransferase class-III  33.65 
 
 		 444 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1957  4-aminobutyrate aminotransferase  33.91 
 
 		 427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  35.84 
 
 		 445 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0447  aminotransferase class-III  33.12 
 
 		 461 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24140  aminotransferase  33.33 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1823  hypothetical protein  32.71 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440887  normal  0.352314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4627  hypothetical protein  32.63 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1464  aminotransferase class-III  34.82 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000155661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  36.14 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  35.28 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  35.92 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3443  aminotransferase class-III  31.92 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000605746  normal  0.17806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 		 426 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  35.1 
 
 		 430 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5776  hypothetical protein  32.61 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0158  hypothetical protein  32.72 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  34.58 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  34.81 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  34.81 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  33.65 
 
 		 426 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  33.58 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  32.2 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1438  aminotransferase class-III  32.74 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.662958  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1870  aminotransferase class-III  33.18 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  33.41 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2386  aminotransferase  36.25 
 
 		 471 aa  226  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.419585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  35.73 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  34.58 
 
 		 425 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  32.37 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.175668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  34.61 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  33.98 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  32.69 
 
 		 440 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  35.94 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  33.17 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  33.87 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  32.54 
 
 		 426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  34.07 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.03 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3362  aminotransferase class-III  36.54 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5005  aminotransferase class-III  36.54 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  32.54 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  32.37 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  32.54 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  34.75 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  35.94 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  35.24 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1430  hypothetical protein  33.99 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360398  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0926  diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.9 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0888484  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5282  aminotransferase class-III  36.3 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6399  hypothetical protein  33.99 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  32.54 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  32.37 
 
 		 426 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  32.37 
 
 		 426 aa  221  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  33.71 
 
 		 456 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>