More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1826 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 233 aa  466  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  62.9 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  38.63 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  39.24 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  39.22 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  32.78 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.59 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  34.95 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  34.95 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  35.32 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  34.18 
 
 		 273 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  33.03 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  29.19 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  29.44 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  28.89 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  28.9 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  29.83 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  29.03 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  29.19 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  29.19 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.19 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  27.31 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  31.14 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  28.57 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.69 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  29.21 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.61 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  28.89 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  28.65 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.74 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  29.36 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  29.83 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  31.32 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  29.83 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  28.02 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  28.02 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  31.87 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  23.98 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2614  ABC transporter, integral membrane protein  30.5 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.838377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  30.6 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  23.98 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  29.44 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  28.65 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>