More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1377 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 368 aa  751    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  49.31 
 
 		 375 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  47.38 
 
 		 370 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  39.88 
 
 		 375 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  35.18 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  35.82 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 371 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 		 376 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 393 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  42.46 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 368 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  35.75 
 
 		 346 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.43 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.74 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  41.96 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 		 372 aa  99.8  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  30.89 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  41.48 
 
 		 418 aa  97.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.67 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 386 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  39.47 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  28.07 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  39.04 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  33.7 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.5 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 419 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 		 660 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 419 aa  89.7  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  27.01 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  25.5 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.84 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 		 1032 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 398 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  26.54 
 
 		 365 aa  85.9  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  38.75 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.75 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  35.95 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.44 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  38.32 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.43 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.75 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.01 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.01 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.01 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  38.03 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 		 419 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.01 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.01 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.01 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.01 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  26.56 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>