More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0304 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3492  peptidase M16 domain-containing protein  70.61 
 
 		 477 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3947  peptidase M16 domain-containing protein  66.03 
 
 		 481 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0210  peptidase M16 domain protein  71.34 
 
 		 497 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.481547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0208  peptidase M16 domain-containing protein  69.45 
 
 		 487 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4129  peptidase M16 domain-containing protein  71.55 
 
 		 492 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3485  peptidase M16-like protein  71.01 
 
 		 502 aa  700    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.320343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4255  peptidase M16 domain-containing protein  71.55 
 
 		 492 aa  684    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3580  peptidase M16 domain-containing protein  66.88 
 
 		 482 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3741  peptidase M16 domain-containing protein  70.7 
 
 		 486 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3814  peptidase M16 domain-containing protein  70.34 
 
 		 487 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0304  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 483 aa  992    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3939  DNA-directed RNA polymerase  70.34 
 
 		 487 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0262  peptidase M16 domain-containing protein  65.91 
 
 		 480 aa  633  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000120782  normal  0.152415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3443  peptidase M16-like protein  67.27 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0261  peptidase M16 domain-containing protein  64.26 
 
 		 481 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2704  peptidase M16 domain protein  48.97 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5792  peptidase M16 domain protein  49.78 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.047663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1866  peptidase M16-like  30.59 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1994  peptidase M16 domain protein  30.57 
 
 		 439 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2079  peptidase M16 domain protein  30.57 
 
 		 439 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1973  peptidase M16 domain-containing protein  31.65 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0091  peptidase M16 domain protein  28.88 
 
 		 767 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0658  peptidase M16 domain protein  28.24 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0678  peptidase M16 domain protein  28.24 
 
 		 490 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4371  peptidase M16-like  29.98 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.325226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0698  peptidase M16 domain protein  27.55 
 
 		 495 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0110  peptidase M16 domain protein  29.52 
 
 		 520 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.282099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0121  peptidase M16 domain protein  29.29 
 
 		 520 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0738  peptidase M16 domain-containing protein  28.54 
 
 		 506 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2345  peptidase M16 domain protein  27.7 
 
 		 490 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.854323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0103  peptidase M16-like  29.05 
 
 		 519 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.968685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0686  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000768524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.32 
 
 		 943 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  30.7 
 
 		 929 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  30.31 
 
 		 949 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0497  peptidase M16 domain protein  27.11 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0152628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2774  peptidase M16-like  28.04 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171699  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3216  peptidase M16 domain-containing protein  25.42 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  30.21 
 
 		 947 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1932  peptidase M16-like  29.15 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3630  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0064  hypothetical protein  28.95 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.73 
 
 		 921 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1980  peptidase, putative  26.25 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2529  peptidase M16-like  24.34 
 
 		 479 aa  174  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  28.5 
 
 		 954 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0735  peptidase M16-like protein  28.05 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.322228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2143  peptidase M16 domain-containing protein  26.3 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0006113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3229  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5339  peptidase M16-like  27.3 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0621  peptidase M16-like  26.16 
 
 		 725 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2752  peptidase M16 domain protein  27.89 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0095  peptidase M16-like  24.76 
 
 		 457 aa  163  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.212806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4046  peptidase M16-like  27.4 
 
 		 444 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  25.11 
 
 		 956 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  25.36 
 
 		 954 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0928  M16 family peptidase  24.66 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 		 949 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1940  peptidase M16-like  26.79 
 
 		 437 aa  158  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  27.78 
 
 		 969 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.91 
 
 		 952 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04870  hypothetical protein  27.02 
 
 		 495 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2986  hypothetical protein  28.54 
 
 		 438 aa  156  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0466  hypothetical protein  27.02 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  28.15 
 
 		 958 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2314  peptidase M16 domain protein  25.26 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.298919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  25.47 
 
 		 952 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2599  hypothetical protein  27.94 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  26.17 
 
 		 947 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3721  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.08 
 
 		 429 aa  154  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0378  insulinase family protein  27.36 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.621778  hitchhiker  0.00954863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2932  peptidase M16 domain-containing protein  24.34 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00273902  normal  0.175117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4177  peptidase M16 domain-containing protein  26.65 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0352  peptidase M16 domain-containing protein  24.95 
 
 		 494 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2726  hypothetical protein  27.71 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3166  peptidase M16-like  28.14 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0425  hypothetical protein  26.01 
 
 		 497 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  25.06 
 
 		 960 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2714  peptidase M16 domain-containing protein  23.43 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.80374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03520  peptidase M16-like protein  26.25 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00585109  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1096  putative zinc protease  25.36 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0917813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2759  peptidase M16 domain-containing protein  25.12 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.482454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02700  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.81 
 
 		 687 aa  149  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4986  peptidase M16 domain-containing protein  26.04 
 
 		 496 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4753  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  25.55 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0542028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  25.65 
 
 		 945 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  24.94 
 
 		 962 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0362  peptidase M16 protein  25.06 
 
 		 437 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0563461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.89 
 
 		 945 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06880  predicted Zn-dependent peptidase  25.65 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408528  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2203  peptidase M16 domain-containing protein  25.24 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.339907  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0188  zinc protease  25.25 
 
 		 454 aa  147  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2736  peptidase M16-like  25 
 
 		 436 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1391  peptidase M16-like  26.3 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0291  peptidase M16 domain-containing protein  24.46 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5113  peptidase M16 domain protein  26.17 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3239  zinc protease  25.29 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00842119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5163  peptidase M16 domain-containing protein  26.24 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  25.18 
 
 		 959 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  24.65 
 
 		 967 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>