More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3061 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3061  major facilitator family transporter  100 
 
 		 402 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3032  major facilitator family transporter  98.76 
 
 		 402 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3220  major facilitator family transporter  98.25 
 
 		 402 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3116  major facilitator family transporter  98.25 
 
 		 402 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0225466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3100  major facilitator family transporter  99.25 
 
 		 402 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 459 aa  342  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0943  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2310  major facilitator superfamily permease  37.84 
 
 		 468 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2227  major facilitator family transporter  37.61 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.61 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0603  major facilitator family transporter  37.61 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1720  major facilitator family transporter  37.61 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1658  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.61 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3715  major facilitator transporter  59.15 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2369  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 452 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0281413  normal  0.52805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0324  major facilitator transporter  50.3 
 
 		 462 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2139  major facilitator transporter  51.38 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666769  normal  0.0573293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47260  putative MFS transporter  48.62 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0707  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.62 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0735  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.21 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.59 
 
 		 558 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  25.49 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.49 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.17 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.71 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.71 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.27 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 510 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.85 
 
 		 480 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.36 
 
 		 545 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.9 
 
 		 480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 		 534 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  25.49 
 
 		 480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.4 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.79 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.39 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.7 
 
 		 520 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.43 
 
 		 579 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  25.49 
 
 		 492 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.49 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  25 
 
 		 492 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 507 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
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NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.84 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 539 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 		 492 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.97 
 
 		 513 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 492 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.52 
 
 		 522 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.82 
 
 		 507 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 		 507 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.57 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 528 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 521 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 		 523 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.09 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.07 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.52 
 
 		 541 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.37 
 
 		 570 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.75 
 
 		 514 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.72 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.93 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.69 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 537 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.11 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.04 
 
 		 558 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.51 
 
 		 509 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.18 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.31 
 
 		 538 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.74 
 
 		 635 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  26.75 
 
 		 523 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 529 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.29 
 
 		 532 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 517 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 525 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_005957  BT9727_0959  permease, general substrate transporter  28.71 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0281229  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.31 
 
 		 534 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.34 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  23.7 
 
 		 496 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0971  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0949  permease, general substrate transporter  29.19 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000025972  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_1038  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.06 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_1116  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.71 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000271146 
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
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NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 646 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
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