More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2605 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.2 
 
 		 877 aa  671    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  49.75 
 
 		 826 aa  740    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  49.94 
 
 		 844 aa  787    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  42.45 
 
 		 811 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 		 866 aa  682    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  54.66 
 
 		 862 aa  907    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  50.29 
 
 		 1072 aa  800    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  100 
 
 		 866 aa  1781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  46.3 
 
 		 826 aa  695    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  63.05 
 
 		 862 aa  1104    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  47.4 
 
 		 826 aa  724    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  79.21 
 
 		 880 aa  1418    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  43.82 
 
 		 856 aa  715    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  66.1 
 
 		 886 aa  1162    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.67 
 
 		 900 aa  740    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  63.02 
 
 		 850 aa  1083    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  51.4 
 
 		 859 aa  808    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  61.62 
 
 		 850 aa  1032    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.33 
 
 		 886 aa  1169    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  45.34 
 
 		 900 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  66.44 
 
 		 886 aa  1170    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  66.44 
 
 		 886 aa  1168    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  46.62 
 
 		 618 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  43.62 
 
 		 608 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  42.33 
 
 		 599 aa  485  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.4 
 
 		 644 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.59 
 
 		 615 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.69 
 
 		 619 aa  416  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.4 
 
 		 639 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  39.62 
 
 		 1271 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  37.63 
 
 		 1271 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  39.2 
 
 		 678 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  39.81 
 
 		 612 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  38.56 
 
 		 605 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.38 
 
 		 736 aa  347  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  32.98 
 
 		 739 aa  342  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  32.26 
 
 		 758 aa  296  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  31.93 
 
 		 755 aa  281  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.78 
 
 		 702 aa  280  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.37 
 
 		 820 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.91 
 
 		 762 aa  278  4e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  32.67 
 
 		 737 aa  271  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.87 
 
 		 750 aa  269  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  31.34 
 
 		 759 aa  268  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32 
 
 		 828 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  32.61 
 
 		 721 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.97 
 
 		 754 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  31.33 
 
 		 738 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.72 
 
 		 752 aa  243  7.999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.72 
 
 		 860 aa  241  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 		 745 aa  240  9e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  30.76 
 
 		 750 aa  238  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  30.51 
 
 		 743 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.22 
 
 		 804 aa  236  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.98 
 
 		 751 aa  236  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  29.58 
 
 		 727 aa  232  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  29.58 
 
 		 727 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04104  periplasmic beta-glucosidase  30.89 
 
 		 723 aa  231  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.97 
 
 		 742 aa  230  9e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  30.44 
 
 		 772 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  30.92 
 
 		 768 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.84 
 
 		 772 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.18 
 
 		 766 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  31.9 
 
 		 859 aa  227  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.39 
 
 		 774 aa  226  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.44 
 
 		 743 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  29.59 
 
 		 766 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  28.94 
 
 		 760 aa  224  7e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  33.16 
 
 		 764 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  31.57 
 
 		 743 aa  221  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.3 
 
 		 723 aa  220  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.18 
 
 		 733 aa  219  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  29.79 
 
 		 740 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.07 
 
 		 783 aa  218  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 753 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.21 
 
 		 762 aa  216  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  28.5 
 
 		 759 aa  216  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.74 
 
 		 765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  30.98 
 
 		 755 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  30.98 
 
 		 765 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  30.98 
 
 		 755 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 		 751 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  30.98 
 
 		 755 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  29.55 
 
 		 772 aa  214  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  30.24 
 
 		 765 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  30.81 
 
 		 755 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.78 
 
 		 777 aa  213  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.78 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3136  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.34 
 
 		 759 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.75 
 
 		 765 aa  211  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.66 
 
 		 756 aa  211  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0331  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.18 
 
 		 724 aa  210  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398461  normal  0.549038 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.85 
 
 		 778 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.61 
 
 		 765 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.61 
 
 		 765 aa  209  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  29.83 
 
 		 763 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  27.85 
 
 		 765 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  31.55 
 
 		 764 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  28.96 
 
 		 765 aa  208  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.47 
 
 		 765 aa  207  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>