229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2712 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  100 
 
 
208 aa  423  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.63 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.53 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  28.65 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  32.84 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  29.74 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30.57 
 
 
534 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  28.78 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  28.82 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.7 
 
 
575 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.87 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  31.41 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.73 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.37 
 
 
534 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.1 
 
 
534 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  29.36 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.75 
 
 
533 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.54 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  29.63 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.1 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.32 
 
 
533 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  27.84 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.87 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  28.28 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.51 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.2 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.52 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  28.65 
 
 
544 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  25.13 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  30.69 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  25.93 
 
 
455 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  28.71 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.14 
 
 
538 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  28.8 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.81 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  27.18 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  29.29 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  25.14 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  27.31 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  28.83 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  26.2 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.36 
 
 
533 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25 
 
 
539 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  27.27 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  28.27 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  24.88 
 
 
202 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  26.06 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.87 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  27.23 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.42 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.38 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  26.91 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.6 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  27.84 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  25.47 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.24 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  32.16 
 
 
206 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  28.19 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0611  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.88 
 
 
449 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.255649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  24.12 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06761  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.89 
 
 
447 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78468  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06371  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.51 
 
 
449 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  25.87 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  26.88 
 
 
185 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  22.8 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  21.54 
 
 
372 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.8 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  25.13 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.38 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  27.03 
 
 
202 aa  55.1  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  22.7 
 
 
393 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0534  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.57 
 
 
450 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000311964  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  23.64 
 
 
368 aa  54.3  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  27.89 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  24.04 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  31.84 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0521  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.57 
 
 
450 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000119793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  26.67 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  22.81 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06671  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.81 
 
 
449 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.432114  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  26.51 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  22.99 
 
 
408 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  27.66 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  29.26 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.23 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.12 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  23.35 
 
 
196 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3606  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.97 
 
 
453 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.311729  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  23.56 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  27.66 
 
 
194 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  21.39 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  27.32 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  21.43 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  27.13 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  26.57 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>