57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0104 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  100 
 
 		 934 aa  1845    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  34.88 
 
 		 847 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  30.63 
 
 		 954 aa  152  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  30.63 
 
 		 954 aa  152  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  31.05 
 
 		 906 aa  107  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  29.34 
 
 		 884 aa  97.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  27.95 
 
 		 939 aa  95.1  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  27.65 
 
 		 894 aa  92.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  30.2 
 
 		 915 aa  89.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  26.22 
 
 		 920 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  28.93 
 
 		 915 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  25.74 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  24.57 
 
 		 823 aa  82.8  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.33 
 
 		 921 aa  79.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  39.49 
 
 		 926 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  28.03 
 
 		 949 aa  76.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  37.93 
 
 		 899 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  21.55 
 
 		 778 aa  75.1  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  34.83 
 
 		 900 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  34.83 
 
 		 900 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  25.75 
 
 		 1312 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  24.56 
 
 		 893 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  40 
 
 		 901 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  34.95 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  28.08 
 
 		 957 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  28.95 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1200 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  23.28 
 
 		 973 aa  62  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  26.15 
 
 		 587 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  27.88 
 
 		 939 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  29.8 
 
 		 1093 aa  60.1  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  27.97 
 
 		 953 aa  60.1  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1201 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1198 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  25.33 
 
 		 573 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  23.97 
 
 		 573 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  26.1 
 
 		 902 aa  52.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  34.52 
 
 		 903 aa  52.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  26.42 
 
 		 573 aa  52.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  23.77 
 
 		 573 aa  52  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  22.83 
 
 		 573 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  30.51 
 
 		 938 aa  51.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1128 aa  50.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  21.25 
 
 		 600 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  23.55 
 
 		 573 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  23.55 
 
 		 573 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  23.3 
 
 		 573 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  22.74 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1242 aa  48.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  24.67 
 
 		 573 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  32.41 
 
 		 891 aa  47  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  30 
 
 		 1139 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  27.91 
 
 		 601 aa  45.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  30.53 
 
 		 304 aa  45.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  32 
 
 		 1133 aa  45.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  30.82 
 
 		 774 aa  44.3  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  28.41 
 
 		 989 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>