99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2555 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  97.63 
 
 
338 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  98.22 
 
 
338 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  100 
 
 
338 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  98.82 
 
 
338 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  77.51 
 
 
337 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  76.04 
 
 
336 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  76.04 
 
 
336 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  76.04 
 
 
336 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  75.81 
 
 
336 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  62.61 
 
 
336 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  58.99 
 
 
336 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  64.2 
 
 
335 aa  394  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  54.84 
 
 
341 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  54.3 
 
 
338 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  54.01 
 
 
337 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  53.25 
 
 
342 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  44.91 
 
 
344 aa  242  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  45.35 
 
 
332 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  38.44 
 
 
365 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  37.57 
 
 
361 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.76 
 
 
342 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  36.98 
 
 
340 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  37.82 
 
 
363 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.56 
 
 
369 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  39.24 
 
 
319 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  39.24 
 
 
346 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  38.54 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  38.19 
 
 
342 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  33.53 
 
 
359 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  31.39 
 
 
331 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  30.67 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  29.08 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  34.41 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  29.38 
 
 
361 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  32.15 
 
 
363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.81 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  28.5 
 
 
363 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  30.29 
 
 
368 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.83 
 
 
299 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  29.71 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.62 
 
 
352 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  27.16 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.69 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.51 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.22 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  29.62 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.38 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  28.38 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  27.71 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  27.22 
 
 
323 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.78 
 
 
325 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  30.03 
 
 
353 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.17 
 
 
314 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  24.02 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.19 
 
 
355 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.41 
 
 
322 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.99 
 
 
322 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.99 
 
 
322 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  28.3 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  31.22 
 
 
320 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.59 
 
 
334 aa  92.8  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25 
 
 
897 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.89 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  34.58 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.43 
 
 
366 aa  59.7  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  33.67 
 
 
421 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  25.12 
 
 
742 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  24.29 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  23.87 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.37 
 
 
340 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  23.84 
 
 
350 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  29.25 
 
 
1527 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  32.56 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  32.56 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  30.46 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  21.98 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  25.17 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  28.87 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  28.12 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.99 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.33 
 
 
321 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  29.2 
 
 
339 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  25.97 
 
 
1120 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  23.33 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  31.82 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  28.49 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.4 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  22.31 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  21.51 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  29.29 
 
 
403 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  23.08 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  28.72 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  34.88 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  28.05 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  34.88 
 
 
338 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  25.1 
 
 
661 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  31.03 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.67 
 
 
616 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  22.26 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>