44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4958 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  37.66 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  36.36 
 
 		 372 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  39.16 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  37.5 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  36.36 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  32.69 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.24 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  31.16 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.4 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  29.44 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  27.49 
 
 		 897 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  28.97 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.32 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  27.27 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  26.42 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.04 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  26.23 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  24.73 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  27.23 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.34 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  31.93 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  29.79 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  30.17 
 
 		 698 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.28 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0669  hypothetical protein  26.99 
 
 		 780 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  27.67 
 
 		 421 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  28.67 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  26.39 
 
 		 661 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.65 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  24.18 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  24.18 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  23.81 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.76 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.17 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  23.89 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  25.73 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>