26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2202 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  100 
 
 		 351 aa  719    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  36.36 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  33.23 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  33.33 
 
 		 372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  34 
 
 		 353 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  32.06 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  30.94 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  34.36 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.62 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.68 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  27.3 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.1 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 897 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  29.46 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  27.13 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  29.47 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  26.49 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.5 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>