43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0295 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  100 
 
 
347 aa  680    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  37.5 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  37 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  36.14 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  35.23 
 
 
353 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  32.06 
 
 
351 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.1 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.01 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  30.85 
 
 
344 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  35.87 
 
 
352 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  33.83 
 
 
348 aa  92  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  26.63 
 
 
897 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  24.26 
 
 
324 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  26.44 
 
 
323 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.98 
 
 
365 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  26.05 
 
 
336 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.21 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5114  glycosyl hydrolase  28.86 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.52 
 
 
323 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5165  glycosyl hydrolase  28.86 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3202  glycosyl hydrolase  28.86 
 
 
404 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  26.64 
 
 
361 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  29.84 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  27.12 
 
 
331 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.91 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.56 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3489  glycosyl hydrolase  30.12 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.371162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.09 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.73 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4563  glycosyl hydrolase  29.65 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.38541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0021  hypothetical protein  25.1 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  21.75 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5088  glycosyl hydrolase  29.65 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  26.27 
 
 
346 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  26.64 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  25.69 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  26.13 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  26.5 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1268  hypothetical protein  25.89 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0664286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  24.71 
 
 
319 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  24.81 
 
 
361 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.42 
 
 
371 aa  42.7  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>