14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10298 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  100 
 
 		 344 aa  699    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  42.34 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  35.91 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  37.82 
 
 		 341 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  38.49 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  36.89 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  31.16 
 
 		 357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  30.85 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  26.81 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.63 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  27.3 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.67 
 
 		 352 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0369  hypothetical protein  31.51 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.415147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>