21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3100 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  100 
 
 		 353 aa  728    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  37.84 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  37.42 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  32.69 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  35.23 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.19 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  36.89 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  32.22 
 
 		 348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  34 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  31.63 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.1 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  24.38 
 
 		 897 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.12 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_013440  Hoch_4465  hypothetical protein  29.41 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.466753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.6 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  30.6 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  43.94 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  31.07 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  50.85 
 
 		 403 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.19 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>