More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0218 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  100 
 
 		 329 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  53.16 
 
 		 318 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  41.1 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  35.25 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  40.18 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  33.9 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  39.65 
 
 		 304 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  34.58 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.59 
 
 		 247 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  40.85 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  40.47 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  39.63 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  47.76 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.65 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  34.98 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  42.92 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 		 241 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 241 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 		 241 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 241 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 241 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 241 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  38.39 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  38.39 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 241 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 241 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.65 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 341 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.27 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  34.45 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  39.08 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.76 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  36.3 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  38.26 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  41.2 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  39.23 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  35.14 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.32 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  41.7 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.75 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  41.2 
 
 		 406 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  38.25 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.78 
 
 		 305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 310 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  37.79 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  37.79 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.79 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  37.79 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  34.8 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  37.62 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  44.98 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.45 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  41.23 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  42.45 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  36.96 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.44 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.76 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  34.58 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  31.49 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  34.89 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  37.06 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  33.98 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  40.64 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.97 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.82 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  39.09 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.61 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  35.41 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  41.06 
 
 		 350 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.92 
 
 		 332 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  33.23 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  41.07 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>