More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5040 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  297  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  98.03 
 
 		 152 aa  291  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  63.95 
 
 		 162 aa  193  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  61.07 
 
 		 151 aa  191  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  62.24 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  62.76 
 
 		 149 aa  180  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  59.21 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  64.34 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  58.94 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  59.15 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  51.41 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  52.08 
 
 		 154 aa  139  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  54.29 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  44.93 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  47.06 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  44.53 
 
 		 167 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 		 165 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.96 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 173 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 171 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 171 aa  87  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.36 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 174 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 167 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  36.05 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  35.57 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.42 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  30.86 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  30.86 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.34 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  27.4 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  38.16 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  30.25 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  30.25 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>