More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4932 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  100 
 
 
423 aa  838    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  50 
 
 
399 aa  350  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  48.74 
 
 
406 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  48.74 
 
 
406 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  48.74 
 
 
406 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  46.25 
 
 
406 aa  330  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  47.49 
 
 
399 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  46.52 
 
 
406 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  44.09 
 
 
399 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  44.41 
 
 
395 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  50 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  41.01 
 
 
401 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  41.55 
 
 
388 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  41.77 
 
 
405 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  41.99 
 
 
430 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  45.62 
 
 
345 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  39.86 
 
 
400 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.45 
 
 
398 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.74 
 
 
408 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  39.57 
 
 
401 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  41.54 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  39.71 
 
 
436 aa  254  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.32 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  38.38 
 
 
407 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  38.38 
 
 
407 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  39.86 
 
 
400 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  42.15 
 
 
423 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  39.34 
 
 
400 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  39.46 
 
 
412 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  40.56 
 
 
415 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  38.44 
 
 
399 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  38.28 
 
 
421 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  40.48 
 
 
408 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.49 
 
 
391 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  43.96 
 
 
357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.82 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.94 
 
 
405 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  38.98 
 
 
400 aa  242  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  39.1 
 
 
414 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  37.99 
 
 
405 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.95 
 
 
394 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  38.55 
 
 
407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  40.16 
 
 
410 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.2 
 
 
410 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.87 
 
 
411 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  41.21 
 
 
395 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  39.55 
 
 
409 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.54 
 
 
400 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.05 
 
 
423 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  36.63 
 
 
400 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.83 
 
 
402 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  39.95 
 
 
400 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  36.83 
 
 
406 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  39.48 
 
 
409 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.44 
 
 
408 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  39.15 
 
 
395 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.34 
 
 
411 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  35.21 
 
 
409 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.6 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  38.75 
 
 
407 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  35.45 
 
 
409 aa  223  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  37.41 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  36.07 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  36.69 
 
 
411 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  36.49 
 
 
403 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  42.11 
 
 
398 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  38.42 
 
 
407 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.7 
 
 
402 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.21 
 
 
395 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  36.36 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  36.1 
 
 
416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.5 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.93 
 
 
412 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.17 
 
 
417 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  35.16 
 
 
393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.57 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  33.67 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  34.67 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  37.89 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  37.5 
 
 
397 aa  212  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.12 
 
 
399 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  36.52 
 
 
405 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  36.9 
 
 
424 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.12 
 
 
401 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  35.63 
 
 
413 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  34.92 
 
 
404 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  35.15 
 
 
421 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  35.15 
 
 
421 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  35.15 
 
 
421 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.31 
 
 
402 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  36.34 
 
 
404 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.87 
 
 
426 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  35.05 
 
 
375 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  35.26 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  35.26 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.69 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.24 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  35.26 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  41.46 
 
 
410 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.81 
 
 
411 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>