More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0728 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  100 
 
 
598 aa  1162    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  91.3 
 
 
598 aa  1053    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  60.54 
 
 
602 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  60.44 
 
 
590 aa  631  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  57.35 
 
 
612 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  56.91 
 
 
592 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  58.42 
 
 
588 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  57.24 
 
 
601 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  56 
 
 
596 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  56.27 
 
 
600 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  57.73 
 
 
602 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  53 
 
 
600 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  53 
 
 
600 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  56.73 
 
 
608 aa  581  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  54.86 
 
 
632 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  56.78 
 
 
592 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  53.69 
 
 
608 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  53 
 
 
613 aa  552  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  53.26 
 
 
611 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  50.89 
 
 
610 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  55.81 
 
 
608 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  50.59 
 
 
608 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  51.48 
 
 
601 aa  528  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  51.09 
 
 
615 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  52.74 
 
 
572 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  52.01 
 
 
587 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  56.14 
 
 
606 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  50.57 
 
 
631 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  48.14 
 
 
609 aa  513  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  50.56 
 
 
628 aa  508  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  49.42 
 
 
591 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  52.33 
 
 
617 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  47.59 
 
 
606 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  53.16 
 
 
616 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  47.56 
 
 
600 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  51.78 
 
 
596 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.14 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  41.92 
 
 
630 aa  460  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  42.36 
 
 
632 aa  434  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  36.02 
 
 
653 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  36.45 
 
 
632 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  35.66 
 
 
629 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  33.65 
 
 
639 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  36.26 
 
 
630 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  36.46 
 
 
631 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
631 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  34.87 
 
 
630 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  35.67 
 
 
631 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  35.67 
 
 
631 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
631 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  35.17 
 
 
642 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  35.61 
 
 
629 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  35.83 
 
 
631 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  35.67 
 
 
631 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 
631 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  34.69 
 
 
632 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  35.67 
 
 
631 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  37.12 
 
 
643 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  36.12 
 
 
626 aa  365  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
642 aa  365  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 
631 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 
631 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  33.83 
 
 
613 aa  361  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  31.99 
 
 
622 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  35.85 
 
 
630 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  36.96 
 
 
630 aa  352  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  35.47 
 
 
631 aa  352  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  32.34 
 
 
620 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  32.91 
 
 
630 aa  346  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  34.09 
 
 
634 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  51.6 
 
 
377 aa  344  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  32.19 
 
 
642 aa  343  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  32.48 
 
 
636 aa  342  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  30.88 
 
 
621 aa  341  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  32.66 
 
 
646 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  32.3 
 
 
644 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  31.1 
 
 
642 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  31.1 
 
 
622 aa  327  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  33.49 
 
 
625 aa  327  3e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  33.23 
 
 
627 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  31.73 
 
 
640 aa  324  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  32.97 
 
 
641 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  35.16 
 
 
631 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  32.97 
 
 
641 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  35.41 
 
 
633 aa  322  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  35.89 
 
 
641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  33.84 
 
 
623 aa  319  9e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  31.09 
 
 
642 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  32.58 
 
 
625 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  32.58 
 
 
625 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  33.54 
 
 
652 aa  314  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  29.74 
 
 
620 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 
622 aa  311  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 
551 aa  301  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
551 aa  300  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
653 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  33.71 
 
 
564 aa  297  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.31 
 
 
551 aa  293  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.16 
 
 
551 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.16 
 
 
551 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>