104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3102 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  56.43 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  51.28 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  51.71 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  49.8 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  49.58 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  50.41 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  45.13 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  42.56 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  42.92 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  28.91 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  22.97 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 325 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 341 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  22.69 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  30.53 
 
 		 566 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  37.8 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  25.77 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  30.37 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  26.38 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  31.35 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  23.19 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  21.23 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  23.2 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 304 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  21.28 
 
 		 228 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  22.84 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  27.85 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  30.22 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  27.21 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  21.74 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  28.29 
 
 		 331 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.32 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  29.85 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.03 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  20.67 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  26.4 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  22.6 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  20.77 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  24.74 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 497 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  23.88 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  25 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  28.24 
 
 		 335 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  24.71 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  26.26 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  29.34 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.5 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  28.05 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 364 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  22.3 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  28.68 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 215 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 322 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  58.62 
 
 		 240 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 352 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>