73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1841 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  60.48 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 		 164 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  40.58 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  35.16 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  43.14 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  32.58 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  33.59 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  32.06 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  33.06 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.01 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  28.24 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  29.75 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  32.2 
 
 		 318 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 		 283 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  27.13 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  29.84 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  30.95 
 
 		 134 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  24.81 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  24.81 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  24.81 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 145 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  30.91 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  25.62 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 156 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  26.83 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 134 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>