137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1605 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  857    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  62 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 427 aa  173  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  24.94 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4959  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 422 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592693  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 408 aa  94  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1684  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2388  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  29.14 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  23.69 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2885  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.281553  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  26.29 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  30 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  30 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.32 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  21.05 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2651  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.936595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 702 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.67 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.9 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0584  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 403 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 523 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.14 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 621 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  29.71 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  30.22 
 
 		 548 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.79 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  25.74 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5307  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 		 530 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 532 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  22.35 
 
 		 496 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.11 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1830  major facilitator superfamily drug efflux transporter  28.4 
 
 		 538 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  28 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 484 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 		 680 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.82 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5331  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  29.69 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1714  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  29.94 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.1 
 
 		 590 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>