73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1684 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1684  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52444  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 401 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2885  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.281553  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2388  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  36.81 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 398 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  36.2 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4959  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592693  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  23.04 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  22.38 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  21.17 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  22.8 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  21.93 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  27.15 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  21.19 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  26.71 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 424 aa  53.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  24.47 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 428 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  24.71 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  24.71 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  24.71 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  21.04 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.82 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  24.1 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  25.56 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 		 530 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.87 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  29.17 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.46 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 524 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>