114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03815 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  100 
 
 		 406 aa  810    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 440 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  24.87 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4959  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592693  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0149  MFS transporter  23.03 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.41 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  21.99 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2885  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.281553  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  22.31 
 
 		 403 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1684  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  22.64 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  25 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3183  transport protein ShiF  25.91 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1859  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4635  ShiF protein  26.22 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0946  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2388  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  22.61 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  20.33 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  23.46 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  20.48 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.44 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  23.44 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.62 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  20.56 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0584  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  21.67 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  22.44 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1295  multidrug transporter  22.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  17.3 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  21.34 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  25.59 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  19.57 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 424 aa  46.6  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 426 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  22.35 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.74 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0970  major facilitator family transporter  25 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.192383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0958  major facilitator family metal-tetracycline/H(+) antiporter  25 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000104996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0948  metal-tetracycline/H+ antiporter  25 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000160748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1037  major facilitator family transporter  25 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  18.33 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1115  major facilitator family transporter  24.38 
 
 		 463 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  23.26 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1355  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.358064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  22.67 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>