146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3283 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  800    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 449 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  26.95 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4959  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592693  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  26.8 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  22.01 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1459  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.71 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2388  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3377  MFS family transporter  26.51 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0683308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2885  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.281553  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2277  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  20.77 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  27.91 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  25.47 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  25.84 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5063  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.97469  hitchhiker  0.00674562 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  21.98 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  20.28 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  21.14 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  23.54 
 
 		 424 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.65 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0149  MFS transporter  25 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  20.83 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  21.2 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3258  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  20.28 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  20.28 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1649  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  22.88 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 422 aa  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0946  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 403 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1684  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52444  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.43 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1657  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.992815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  20.28 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.47 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  20.28 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.72 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  22.11 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.72 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1625  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0979521  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1716  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  20.06 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 421 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.11 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>