27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0923 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  788    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  84.52 
 
 		 407 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  84.03 
 
 		 407 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  83.54 
 
 		 407 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0946  major facilitator superfamily MFS_1  59.44 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3183  transport protein ShiF  58.07 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4635  ShiF protein  57.83 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0149  MFS transporter  35.63 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0584  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  24.21 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1815  hypothetical protein  28.34 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3258  major facilitator transporter  28 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  30 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  26.45 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5063  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.97469  hitchhiker  0.00674562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.57 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>