28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0946 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0946  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 403 aa  765    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4635  ShiF protein  80 
 
 		 397 aa  560  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3183  transport protein ShiF  77.84 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  59.44 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  58.04 
 
 		 407 aa  363  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  57.54 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  57.54 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0149  MFS transporter  37.39 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0584  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3258  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  22.88 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  21.55 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1815  hypothetical protein  32.37 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5063  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.97469  hitchhiker  0.00674562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>