45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3258 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3258  major facilitator transporter  100 
 
 		 392 aa  744    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5063  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.97469  hitchhiker  0.00674562 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0149  MFS transporter  24.93 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3183  transport protein ShiF  28.06 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4635  ShiF protein  28.18 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0946  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1815  hypothetical protein  28.15 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0584  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4959  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592693  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  25.14 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39850  putative MFS transporter  29.46 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.64 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0190  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  24.08 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2657  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.86 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  24.88 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 440 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 399 aa  46.6  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2388  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2897  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 565 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  25.99 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  24.59 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2805  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.438181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.46 
 
 		 525 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>