31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4635 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3183  transport protein ShiF  90.82 
 
 		 397 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4635  ShiF protein  100 
 
 		 397 aa  764    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0946  major facilitator superfamily MFS_1  80 
 
 		 403 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  57.83 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  58.79 
 
 		 407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  58.01 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0149  MFS transporter  37.97 
 
 		 382 aa  182  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0584  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3258  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  26.74 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5063  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 435 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.97469  hitchhiker  0.00674562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1815  hypothetical protein  27.34 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1570  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.59 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>