41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0584 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0584  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  796    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0923  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.462621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0946  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0788  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 407 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0188  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 407 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.625816  hitchhiker  0.000266696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0715  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0149  MFS transporter  26.35 
 
 		 382 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3183  transport protein ShiF  29.61 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4635  ShiF protein  40.11 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3258  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.7 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1815  hypothetical protein  27.1 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2520  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  26.26 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4848  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869631  normal  0.114324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1605  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.983244  normal  0.202214 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  20.92 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  21.46 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03815  putative mfs transporter  23.87 
 
 		 406 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.68 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0868  major facilitator transporter  20.92 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.201883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  24.04 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2657  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4365  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.04 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0097  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3283  major facilitator transporter  18.62 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  22.63 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.87 
 
 		 1876 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1927  major facilitator transporter  18.58 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  22.91 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>