85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1079 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 176 aa  327  6e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.36 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  59.63 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  42.21 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  42.21 
 
 		 159 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  38.96 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  39.61 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.16 
 
 		 161 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.06 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  40.34 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  32.03 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.59 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  41.4 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.52 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  37.74 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  41.83 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  41.18 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  35.9 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  41.89 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.42 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.03 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.75 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  42.62 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.88 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.6 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  36.3 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.57 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.45 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.55 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  35.36 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  34.59 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  34.3 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.52 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.54 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.74 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  44.12 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  27.47 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  32.87 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.91 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  33.7 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.41 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  25.93 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16551  F0F1 ATP synthase subunit B  27.43 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.513601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.48 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.41 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.04 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.85 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.86 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  30.28 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  30.28 
 
 		 164 aa  47.8  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.82 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 		 238 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  24.18 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 		 194 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.48 
 
 		 208 aa  44.3  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.64 
 
 		 160 aa  44.3  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.48 
 
 		 208 aa  44.3  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  25.16 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  32.23 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  29.67 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.59 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0334  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.603951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  29.67 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.54 
 
 		 264 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  26.04 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 		 164 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  25.86 
 
 		 175 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.32 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.25 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  32.62 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  30 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>