169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0605 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  70.64 
 
 		 569 aa  791    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1164    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  65.06 
 
 		 544 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  38.12 
 
 		 570 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  37.2 
 
 		 583 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  36.83 
 
 		 583 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  36.53 
 
 		 628 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  36.76 
 
 		 583 aa  339  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  35.85 
 
 		 584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  36.04 
 
 		 582 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  35.56 
 
 		 617 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  35.73 
 
 		 693 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  37.12 
 
 		 674 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  38.13 
 
 		 679 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  34.13 
 
 		 560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  37.24 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  34.12 
 
 		 662 aa  303  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  35.97 
 
 		 612 aa  302  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 626 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  32.26 
 
 		 575 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  31.66 
 
 		 546 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  29.92 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  29.01 
 
 		 607 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  30.02 
 
 		 550 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  30.7 
 
 		 591 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  30.17 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  29.93 
 
 		 709 aa  227  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  28.3 
 
 		 623 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  29.48 
 
 		 679 aa  224  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  29.06 
 
 		 595 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  29.79 
 
 		 591 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  27.59 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  28.15 
 
 		 587 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  31.36 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  28.77 
 
 		 579 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  28.79 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  29.33 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  32.52 
 
 		 714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  37.44 
 
 		 709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  27.51 
 
 		 581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  23.92 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  30.74 
 
 		 659 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  25.82 
 
 		 510 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.87 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  42.4 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.64 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  25.77 
 
 		 531 aa  107  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.05 
 
 		 520 aa  107  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  25.88 
 
 		 496 aa  106  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  34.25 
 
 		 563 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  27.18 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  34.64 
 
 		 603 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 		 559 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  23.81 
 
 		 493 aa  105  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  23.58 
 
 		 497 aa  104  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  29.18 
 
 		 508 aa  103  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  31.58 
 
 		 664 aa  103  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25.52 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  23.36 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  32.37 
 
 		 670 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  22.67 
 
 		 564 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  40.29 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  28.08 
 
 		 617 aa  99  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  32.77 
 
 		 601 aa  98.2  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  37.01 
 
 		 557 aa  98.2  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.82 
 
 		 674 aa  97.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  27.15 
 
 		 492 aa  93.2  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  30.26 
 
 		 600 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.52 
 
 		 608 aa  91.7  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  31.84 
 
 		 611 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  32.32 
 
 		 605 aa  89.7  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  34.42 
 
 		 616 aa  89  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.59 
 
 		 628 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  25.91 
 
 		 524 aa  87  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  35.95 
 
 		 561 aa  87  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  38.39 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  35.51 
 
 		 570 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  25.89 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  24.44 
 
 		 589 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  25.12 
 
 		 590 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  22.35 
 
 		 540 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  36.69 
 
 		 567 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  24.52 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  33.33 
 
 		 360 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  24.29 
 
 		 539 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0018  protein of unknown function DUF87  31.58 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.989354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  22.87 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.76 
 
 		 523 aa  67.4  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  26.09 
 
 		 592 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  34.33 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1625  hypothetical protein  22.38 
 
 		 783 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  35.06 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  29.41 
 
 		 580 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  37.76 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  34.75 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  29.63 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  29.63 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  29.63 
 
 		 530 aa  60.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  30.72 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  31.54 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>