More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1701 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  100 
 
 
578 aa  1160    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.97 
 
 
871 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  42.65 
 
 
885 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.41 
 
 
558 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.01 
 
 
556 aa  426  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.34 
 
 
557 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
563 aa  428  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
555 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.78 
 
 
561 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
561 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
568 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.44 
 
 
558 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  40.59 
 
 
891 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.11 
 
 
577 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.37 
 
 
888 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  40.47 
 
 
561 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
553 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.93 
 
 
571 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 
520 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
558 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 
520 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.23 
 
 
603 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  53.08 
 
 
727 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  44.62 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
568 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.59 
 
 
568 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.12 
 
 
568 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  39.43 
 
 
559 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.5 
 
 
557 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  43.06 
 
 
599 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.57 
 
 
514 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.86 
 
 
568 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.56 
 
 
553 aa  399  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
520 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.68 
 
 
568 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.59 
 
 
599 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
573 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  41.22 
 
 
521 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.53 
 
 
553 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.95 
 
 
568 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.65 
 
 
552 aa  395  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  40.17 
 
 
570 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  36.93 
 
 
554 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.68 
 
 
568 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.25 
 
 
599 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.57 
 
 
563 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.28 
 
 
571 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  50.38 
 
 
518 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  38.81 
 
 
570 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  38.93 
 
 
580 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.1 
 
 
566 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.95 
 
 
568 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  46.67 
 
 
487 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  36 
 
 
572 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  38.49 
 
 
565 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  39.45 
 
 
577 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.56 
 
 
568 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48.09 
 
 
500 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.5 
 
 
568 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.39 
 
 
570 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  37.52 
 
 
645 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  48.6 
 
 
501 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.25 
 
 
571 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.66 
 
 
568 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  48.09 
 
 
503 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.7 
 
 
559 aa  385  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  49.36 
 
 
511 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  37.54 
 
 
585 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  38.36 
 
 
561 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  36.29 
 
 
577 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0861  type II secretion system protein E  36.92 
 
 
642 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  36.86 
 
 
553 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
564 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.34 
 
 
787 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.78 
 
 
571 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  44.34 
 
 
523 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  38.9 
 
 
573 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  42.12 
 
 
560 aa  375  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  38.98 
 
 
841 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  38.01 
 
 
571 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
564 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
546 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
561 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  39.42 
 
 
567 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  44.39 
 
 
521 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  41.53 
 
 
500 aa  369  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  48.98 
 
 
498 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
568 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  38.8 
 
 
668 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  47.04 
 
 
497 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  48.6 
 
 
491 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  43.25 
 
 
497 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  49.48 
 
 
498 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  45.23 
 
 
642 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  37.17 
 
 
561 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  47.04 
 
 
497 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  49.1 
 
 
514 aa  372  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  38.29 
 
 
589 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  43.48 
 
 
497 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.74 
 
 
569 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>