More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1921 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 522 aa  1030    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.57 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1134  ABC transporter related protein  30.74 
 
 		 527 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1060  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.29 
 
 		 546 aa  216  7e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000222541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1609  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 529 aa  213  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0437  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.43 
 
 		 544 aa  193  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000598292  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  29.71 
 
 		 530 aa  193  6e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  27.23 
 
 		 577 aa  179  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  29.15 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  28.6 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.77 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  25.21 
 
 		 588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.14 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  24.91 
 
 		 541 aa  143  9e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0215  ABC transporter related  26.06 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  26.43 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  25.11 
 
 		 580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.89 
 
 		 622 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  28.38 
 
 		 534 aa  133  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  22.57 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  21.26 
 
 		 640 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  23.93 
 
 		 576 aa  127  7e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1925  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.89 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  22.45 
 
 		 648 aa  123  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.07 
 
 		 552 aa  121  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1694  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.78 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0047408  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1311  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.2 
 
 		 534 aa  120  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  20.11 
 
 		 654 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  24.75 
 
 		 727 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  20.55 
 
 		 638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  25.49 
 
 		 631 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  23.11 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1525  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.31 
 
 		 528 aa  118  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000153215  normal  0.145022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  24.09 
 
 		 659 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0957  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.99 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000800141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.58 
 
 		 581 aa  117  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  25 
 
 		 618 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  20.55 
 
 		 627 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.63 
 
 		 575 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0272  ABC transporter related  33.67 
 
 		 578 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.933843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  34.28 
 
 		 575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  22.84 
 
 		 635 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  26.3 
 
 		 554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.04 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.14 
 
 		 738 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  20.59 
 
 		 642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  20.5 
 
 		 626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  23.12 
 
 		 636 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  21.41 
 
 		 620 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  21.98 
 
 		 648 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  24.72 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  20.72 
 
 		 632 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  23.81 
 
 		 593 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  19.01 
 
 		 639 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  26.11 
 
 		 611 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  24.51 
 
 		 640 aa  113  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.84 
 
 		 593 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.12 
 
 		 637 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.5 
 
 		 584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  21.91 
 
 		 598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  23.25 
 
 		 606 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.58 
 
 		 702 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  24.18 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.18 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  24.18 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.18 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.18 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.43 
 
 		 593 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.63 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.63 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.01 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.63 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.18 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  22.29 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  31.98 
 
 		 584 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  20.47 
 
 		 627 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2302  ABC transporter related protein  32.9 
 
 		 582 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  20.47 
 
 		 627 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.51 
 
 		 573 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.99 
 
 		 580 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24 
 
 		 571 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  23.9 
 
 		 581 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  21.43 
 
 		 638 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  20.52 
 
 		 611 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  24.03 
 
 		 617 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  22.47 
 
 		 611 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  23.02 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  21.75 
 
 		 585 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  20.15 
 
 		 580 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  24.28 
 
 		 556 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  24.58 
 
 		 608 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  19.6 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  24.12 
 
 		 571 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.64 
 
 		 637 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  24.66 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.41 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0956  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.92 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000165246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.9 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  21.68 
 
 		 597 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  25.11 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>