More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4151 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 334 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  94.01 
 
 		 334 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  82.63 
 
 		 330 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  82.04 
 
 		 330 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  55.47 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  52.16 
 
 		 341 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  51.8 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  51.44 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  46.79 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  49.65 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  50.72 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  50.72 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  50 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  50.74 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  50.74 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  50.74 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  50.74 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  50.74 
 
 		 362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  49.3 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  35.38 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  35.38 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  35.38 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  35.02 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  35.02 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  35.02 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  35.74 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  34.3 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  34.53 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1389  hypothetical protein  32.65 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  32.65 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  34.91 
 
 		 293 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  35.38 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  34.17 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  32.03 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  33.7 
 
 		 478 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  33.45 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  32.38 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  32.14 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  33.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  33.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  32.38 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  33.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  33.1 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  32.86 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  33.1 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  33.1 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  32.26 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  31.99 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  29.62 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  31.34 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  32.86 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  31.56 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  32.38 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  32.4 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  31.9 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  30.21 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2022  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.664089  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2039  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2085  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.793939  normal  0.404703 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  32.99 
 
 		 471 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  30.74 
 
 		 470 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  32.06 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  31.43 
 
 		 475 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  31.45 
 
 		 301 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  30.82 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  31.9 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  32.63 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  30.47 
 
 		 470 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  30.71 
 
 		 482 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4321  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  30.6 
 
 		 387 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  29.64 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3795  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0520356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 471 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  30.8 
 
 		 471 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  29.89 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1343  urate catabolism protein  30.71 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0882664  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4489  chitin deacetylase  29.76 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  30.6 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  31.07 
 
 		 470 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  29.01 
 
 		 312 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.96 
 
 		 475 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>