More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1168 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0809  lytic transglycosylase, catalytic  90.13 
 
 		 669 aa  1237    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1168  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 669 aa  1360    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2251  putative bacteriophage protein  43.36 
 
 		 632 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2403  hypothetical protein  38.84 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1814  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.69 
 
 		 677 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4158  hypothetical protein  31.75 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3642  hypothetical protein  29.28 
 
 		 597 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  51.72 
 
 		 367 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  40.65 
 
 		 241 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  44.17 
 
 		 260 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 260 aa  104  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  41.26 
 
 		 258 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  42.19 
 
 		 196 aa  101  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 251 aa  97.8  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  48.72 
 
 		 199 aa  94.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1985  hypothetical protein  27.2 
 
 		 711 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3084  Lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 623 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49.12 
 
 		 368 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 198 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  48.6 
 
 		 208 aa  89.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 282 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 		 194 aa  88.2  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 		 208 aa  87.8  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  39.34 
 
 		 261 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 261 aa  87.4  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  39.34 
 
 		 261 aa  87.4  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 206 aa  87.4  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  46.85 
 
 		 327 aa  87  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  39.34 
 
 		 261 aa  87.4  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1293  hypothetical protein  25.46 
 
 		 629 aa  86.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  42.98 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3643  hypothetical protein  26.06 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  42.98 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1025  hypothetical protein  25.2 
 
 		 629 aa  83.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1262  hypothetical protein  25.2 
 
 		 629 aa  83.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  44.95 
 
 		 197 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  44.95 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0077  Lytic transglycosylase catalytic  35.2 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  40.3 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 		 189 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  37.88 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  37.7 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  37.7 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  37.7 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  34.72 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  37.7 
 
 		 261 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  42.59 
 
 		 203 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 		 261 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  43.69 
 
 		 272 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  37.7 
 
 		 261 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  43.14 
 
 		 217 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40.54 
 
 		 174 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  34.72 
 
 		 204 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.45 
 
 		 188 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  44.95 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  38.14 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  36.59 
 
 		 216 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  35.66 
 
 		 196 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  42.73 
 
 		 234 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  37.82 
 
 		 202 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.52 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.08 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  37.09 
 
 		 733 aa  74.7  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.44 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  44.66 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  31.76 
 
 		 194 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  42.72 
 
 		 280 aa  73.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  39.32 
 
 		 498 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  43.81 
 
 		 438 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 261 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  43.81 
 
 		 442 aa  73.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  37.8 
 
 		 285 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.67 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  36 
 
 		 191 aa  73.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  38.53 
 
 		 328 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 206 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0798  lytic transglycosylase catalytic  41.74 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.44501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  37.93 
 
 		 556 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  45.79 
 
 		 246 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  37.93 
 
 		 596 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  34.84 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 293 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.34 
 
 		 291 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  37.82 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>