65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2220 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2220  universal stress protein  100 
 
 		 143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.344248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1796  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1762  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1269  universal stress protein  30.77 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.779976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  34.69 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  29.86 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  35.37 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  34.69 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  34.01 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  34.01 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  34.01 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  34.01 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  34.01 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  34.01 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  29.17 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.22 
 
 		 305 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  27.21 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  21.13 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.89 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  26.57 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  26.79 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.05 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  30.95 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  25.69 
 
 		 293 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  24.31 
 
 		 293 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  30.95 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  22.38 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0737  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  23.08 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  25.6 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  23.29 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  29.93 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  22.92 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  23.24 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  27.81 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  25 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  25.85 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  25.32 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  24.66 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  26.06 
 
 		 622 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  23.49 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25.52 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  26.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.63 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  27.45 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  28.86 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  27.38 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  26.32 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  29.79 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  21.33 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  26.32 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  23.03 
 
 		 304 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1531  UspA domain protein  23.97 
 
 		 171 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00154671  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  27.67 
 
 		 157 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>