More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2196 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  47.46 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  45.79 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 		 158 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  51.02 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  45.69 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  44.83 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  44.83 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  39.13 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  47.22 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  38.41 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  46.73 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.73 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.73 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.19 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  42.37 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  46.73 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  46.73 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  46.73 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  40.32 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 146 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.34 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  44.07 
 
 		 195 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  46.74 
 
 		 154 aa  98.6  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 168 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  39.29 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  42.31 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 185 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  46.94 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  38.52 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  36.3 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  37.7 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 171 aa  94.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 155 aa  94.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>