More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1956 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 381 aa  781    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 		 660 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 808 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 669 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  28.49 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 678 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  26.72 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 762 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  28.27 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.79 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  24.7 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 890 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  21.13 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  24.15 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  24.66 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 368 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  21.66 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  26.7 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  26.7 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  22.49 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  26.51 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  23.01 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2882  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  23.82 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  24.88 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  22.63 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  27.01 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  20.34 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  28.7 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  18.9 
 
 		 1264 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  23.02 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  20.26 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 1032 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  30.63 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  19.95 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  30.63 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.15 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  28.65 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 		 502 aa  67  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  27.12 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.98 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  21.4 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 689 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  22.22 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.38 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  25 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  27.56 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  25.22 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  21.73 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>