More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0984 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0984  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 276 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101875  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3424  ABC transporter-related protein  32.55 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  28.12 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0826  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.422704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  30.56 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1874  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  28.96 
 
 		 310 aa  99.8  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  32.02 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  30.05 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  27.83 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  24.56 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4483  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4887  putative ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  28.3 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  35.38 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  30.11 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  28.29 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  25.37 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4501  ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  25.37 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  29.6 
 
 		 369 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  25.75 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4648  ABC transporter ATP-binding protein  32.28 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  25.37 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5003  ABC transporter ATP-binding protein  32.28 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  25.37 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  31.4 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4581  ABC transporter related  33.33 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  25.37 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  30.43 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.66 
 
 		 310 aa  95.5  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  25.75 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  29.3 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  28.5 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  25.41 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  29.52 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  28.8 
 
 		 332 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  26.64 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0617  ABC transporter related  28.37 
 
 		 243 aa  92.8  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.854528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  29.61 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4863  putative ABC transporter, ATP-binding protein  32.28 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  25 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  25.37 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  25.74 
 
 		 308 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  27.83 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  23.53 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  28.12 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  27.67 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  27.57 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  24.91 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  29.11 
 
 		 232 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  27.54 
 
 		 319 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  24.3 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  29.41 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  26.76 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1068  ABC transporter related  29.15 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  24.52 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  25.4 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  25.33 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  29.27 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  31.84 
 
 		 233 aa  90.1  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  26.94 
 
 		 323 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  25.4 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  27.17 
 
 		 296 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  24.33 
 
 		 312 aa  89.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  27.64 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  26.57 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  27.6 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  27.8 
 
 		 234 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  28.02 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  23.81 
 
 		 368 aa  88.6  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.22 
 
 		 344 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3400  ABC transporter related protein  30.11 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0345809  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  24.54 
 
 		 337 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  28.29 
 
 		 336 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  31.34 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  26.02 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  24.88 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  28.5 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  25.36 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  23.37 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  28.57 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  28.22 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  30.69 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  24.75 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  24.27 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1757  ABC transporter related  20 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2222  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0568841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  24.37 
 
 		 382 aa  86.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2694  ABC transporter related  24.53 
 
 		 354 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  27.64 
 
 		 357 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  26.34 
 
 		 323 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  25.61 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2052  ABC transporter related  32.8 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>