More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0617 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0617  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.854528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0208  ABC transporter related protein  68.18 
 
 		 248 aa  342  4e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  48.95 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  49.79 
 
 		 243 aa  221  9e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  48.95 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1420  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  44.35 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0214  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0225  ABC transporter related  38.43 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1322  ABC transporter related  38.86 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  39.81 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 305 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  40.19 
 
 		 300 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 305 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 305 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  42.24 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 305 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  36.59 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  40 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.55 
 
 		 318 aa  155  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  40.64 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 318 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 302 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  35.61 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  35.61 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  35.61 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  39.48 
 
 		 305 aa  148  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  35.68 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  35.27 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 305 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  40.91 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0676  ABC transporter related  35.21 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.620401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 306 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  38.08 
 
 		 310 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1800  ABC transporter related  34.13 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.503709  normal  0.72569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1642  ABC transporter related  34.62 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00844741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  43.35 
 
 		 304 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1756  ABC transporter related  33.65 
 
 		 303 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.75 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  37.32 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.63 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2522  ABC transporter related  33.65 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.575143  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2484  ABC transporter related  37.02 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.013646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1763  ABC transporter related  33.65 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1477  ABC transporter related  37.76 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  35.86 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  38.43 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 300 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1109  ABC transporter related  34.8 
 
 		 303 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.67 
 
 		 319 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 315 aa  142  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.5 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 583 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.08 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.28 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  40 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 302 aa  141  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  34.44 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  34.31 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  32.64 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  34.13 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  33.2 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  35.51 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  35.81 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  34.07 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04340  ABC transporter related  35.56 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  37.83 
 
 		 341 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.04 
 
 		 317 aa  139  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  38.79 
 
 		 325 aa  139  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>